Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NKX2-5P52952 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms