Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CENPAP49450 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPAP49450 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms