Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NESP48681 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NESP48681 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
NESP48681 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NESP48681 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NESP48681 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NESP48681 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
NESP48681 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NESP48681 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
NESP48681 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NESP48681 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NESP48681 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
NESP48681 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NESP48681 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
NESP48681 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NESP48681 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms