Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATRXP46100 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATRXP46100 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATRXP46100 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATRXP46100 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms