Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNA4P43681 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNA4P43681 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms