Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP62P37198 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP62P37198 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms