Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM4SF1P30408 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TM4SF1P30408 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms