Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CD1BP29016 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CD1BP29016 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD1BP29016 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD1BP29016 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CD1BP29016 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD1BP29016 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD1BP29016 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD1BP29016 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD1BP29016 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD1BP29016 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CD1BP29016 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CD1BP29016 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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