Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ITGA3P26006 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ITGA3P26006 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms