Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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CTSSP25774 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTSSP25774 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTSSP25774 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSSP25774 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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