Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAMP1P23763 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms