Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CALB2P22676 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CALB2P22676 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALB2P22676 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALB2P22676 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CALB2P22676 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CALB2P22676 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CALB2P22676 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms