Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CDK11BP21127 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms