Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4BPBP20851 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms