Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2CP19387 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms