Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIG1P18858 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIG1P18858 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIG1P18858 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIG1P18858 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIG1P18858 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIG1P18858 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIG1P18858 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LIG1P18858 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LIG1P18858 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
LIG1P18858 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
LIG1P18858 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
LIG1P18858 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms