Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGB6P18564 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms