Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXB9P17482 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms