Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZKSCAN1P17029 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZKSCAN1P17029 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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