Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CCL3L1P16619 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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