Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CREB1P16220 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB1P16220 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB1P16220 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB1P16220 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB1P16220 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CREB1P16220 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CREB1P16220 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CREB1P16220 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms