Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PRG2P13727 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PRG2P13727 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PRG2P13727 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PRG2P13727 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PRG2P13727 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms