Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MS4A1P11836 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms