Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGAMP11215 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ITGAMP11215 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms