Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RGPD2P0DJD1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RGPD2P0DJD1 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms