Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYBBP04839 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYBBP04839 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms