Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SYF2O95926 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYF2O95926 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYF2O95926 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYF2O95926 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYF2O95926 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYF2O95926 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYF2O95926 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms