Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GABARAPO95166 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms