Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SYNGR2O43760 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms