Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTATSF1O43719 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTATSF1O43719 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms