Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
EBAG9O00559 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EBAG9O00559 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms