Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMD9O00233 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms