Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HMGB1P1B2RPK0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms