Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM3

RIMBP3B, RIMS-binding protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3BA6NNM3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIMBP3BA6NNM3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RIMBP3BA6NNM3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms