Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LIPT2A6NK58 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LIPT2A6NK58 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms