Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SERINC4A6NH21 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERINC4A6NH21 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms