Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LRP5LA4QPB2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms