Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC162PA2VCL2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC162PA2VCL2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms