Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IRGMA1A4Y4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IRGMA1A4Y4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms