Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KPZ7 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KPZ7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KPZ7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KPZ7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KPZ7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KPZ7 UCHL3-206ENST00000618773 1050 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
U3KPZ7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KPZ7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KPZ7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KPZ7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KPZ7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KPZ7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KPZ7 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
U3KPZ7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
U3KPZ7 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC098483.1-201ENST00000438623 955 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
U3KPZ7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms