Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MAP3K4Q9Y6R4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms