Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
HECTD4Q9Y4D8 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms