Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NRXN3Q9Y4C0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms