Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPRKBQ9Y3C4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms