Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHDC2Q9Y2U9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms