Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC8Q9Y2L5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms