Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRAPPC4Q9Y296 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms