Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms