Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HHLA3Q9XRX5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms