Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CEP164Q9UPV0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CEP164Q9UPV0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms